多西環素用于下列細菌引起的感染：
?立克次體屬(洛山基斑疹熱，斑疹傷寒熱，斑疹傷寒癥，Q熱，立克次氏體痘，脾熱等)
?支原體肺炎(類胸膜肺炎菌，Eaton Agent)
?鸚鵡熱和鳥疫
?性病淋巴肉芽腫和腹股溝肉芽腫
?回歸熱螺旋體(包柔氏螺旋體菌)
下列革蘭氏陽性菌：
?杜克雷嗜血桿菌(軟性下疳)
?鼠疫巴斯德(氏)菌和土拉然巴斯德(氏)菌
?桿狀巴爾通氏體屬
?類桿菌屬
?逗號弧菌和胚胎弧菌
?布魯氏菌(與鏈霉素合用)
由于下列菌群中多數菌種對四環素耐藥，建議進行敏感性實驗。
若細菌敏感性實驗表明對藥物有一定的敏感性，多西環素可用于下列革蘭氏陰性菌引起的感染：
?埃希氏大腸桿菌屬
?產氣腸桿菌
?志賀菌屬
?Mima菌屬和赫爾氏菌屬
?流感嗜血桿菌(呼吸道感染)
?克雷伯氏菌屬(呼吸道和尿路感染)
下列革蘭氏陽性菌引起的感染：
?鏈球菌：44%化膿性鏈球菌和74%糞鏈球菌對四環素類藥物有耐藥性。因此，四環素類藥物不適用于鏈球菌引發的感染，除非敏感性很強。
對于A型β－溶血性鏈球菌引起的上呼吸道感染和風濕熱的預防，青霉素是首選藥物。
?肺炎雙球菌
?金黃色葡萄球菌：呼吸道、皮膚和軟組織感染
四環素類藥物不是葡萄球菌感染的首選藥物。
當青霉素禁忌時，多西環素可作為候補藥物用于下列細菌引起的感染：
?淋病奈瑟球菌和腦膜炎奈瑟球菌
?梅毒螺旋體和極細密螺旋體(梅毒和雅司病)
?單核細胞增生性里斯特桿菌﹒梭菌屬﹒炭疽芽孢桿菌
?梭形梭桿菌
?放線菌屬
對急性腸內阿米巴疾病，多西環素可以作為輔助治療藥物。
盡管螢光免疫檢驗法證實感染因子并未消除，但多西環素仍用于砂眼的治療。